申花备战剩余的中超联赛和足协杯比赛时，由于国家队和亚运队调走了许多球员，他们连分组对抗的训练都无法进行。9月5日，申花结束了短暂的5天假期，重新集结在久事康桥体育基地，为接下来的6轮比赛做准备。

全队结束假期回来后，主教练吴金贵面临着球队人员不足的问题。柏佳骏已经离队，申花的一线队只剩下34人，但这次集结时只有21人能参加训练。队长吴曦因伤复出后回国家队，朱辰杰、蒋圣龙、徐皓阳、汪海健、戴伟浚、周俊辰、张威和温家宝等8人被亚运队征召，何龙海、费尔南多、金顺凯和朱越参加国奥的集训和比赛。

即使没有伤病，申花只有21人参加这个训练期间，包括守门员马镇、鲍亚雄、周正凯等在内，人数实在太少了，无法进行分组对抗。主教练吴金贵表示：“确实是人太少了，分组对抗都打不了，我们只能想办法克服，尽可能减小影响。”

对于申花来说，受影响的不仅仅是训练，更重要的是成绩可能会下滑。申花在接下来的两三轮比赛中可能会出现人员不足的问题，有可能被挤出前三名的位置。

9月19日，男足亚运队将开始参加亚运会。中超第三阶段的比赛从9月15日开始，申花将在9月16日客场对阵河南，9月22日回到主场迎战沧州雄狮。申花将缺少8名队员，特别是朱辰杰和蒋圣龙这两名防线核心的缺阵将是无法弥补的损失。

如果亚运队能顺利前进，那么申花在第27轮对阵青岛海牛的比赛也将受到人员不足的影响。

从最近一段时间的比赛来看，申花由于没有进一步加强阵容，在后期表现乏力，尤其是在其他俱乐部有所补强的情况下，申花的困难更加明显。