根据米兰新闻网的报道，据称米兰拒绝了里昂以1300万欧元的报价来购买克鲁尼奇的提议。米兰的这一决定是基于球员的首发地位以及寻找替补球员的时间不足。

首先，克鲁尼奇在米兰队内具有重要的技术作用，受到主教练皮奥利以及队友们的欣赏和认可，因此成为球队的首发球员。米兰方面对他的表现非常满意，因此拒绝了里昂的报价。

其次，距离夏季转会窗口关闭的时间只剩下不到48小时，米兰已经来不及寻找并签下合适的替补球员。考虑到球队目前的战略和计划，出售克鲁尼奇意味着球队将面临中场人员的短缺问题，这是米兰不愿意承担的风险。

目前，米兰方面决定留下克鲁尼奇，以确保球队的稳定和持续的竞争力。虽然里昂的报价符合米兰之前对克鲁尼奇的要价，但由于上述原因，米兰选择保留克鲁尼奇，并继续依靠他在球场上发挥重要作用。

这一决定对于米兰而言并非易事，但在当下的情况下，他们认为保留克鲁尼奇对球队更加有利。毕竟，稳定的阵容和默契的合作是球队取得成功的关键因素，而这正是克鲁尼奇所能提供的。

尽管里昂的兴趣和报价表明克鲁尼奇的价值受到广泛认可，但米兰坚定地表示他们计划继续与克鲁尼奇合作，并力图在未来的比赛中取得更大的成功。

总的来说，米兰决定保留克鲁尼奇，这是出于球队现有首发球员的重要性以及寻找替补球员时间紧迫的考虑。他们相信这一决策能够维持球队的稳定性并有助于取得更好的成绩。